Se invita a la aprendiz de maga Chise Hatori a inscribirse en el Colegio, una prestigiosa institución de aprendizaje para hechiceros, para examinar y buscar una forma de eliminar las maldiciones que lleva. A pesar de la desgana de su novio Elias Ainsworth, Chise acepta la propuesta, ya que cree que asistir a la escuela podría ayudarla a minimizar sus tendencias al sacrificio.
Desde el primer momento, Chise llama la atención de sus compañeros y profesores por igual, que nunca antes habían visto a un mago en acción. Sin embargo, se está gestando un siniestro complot a espaldas del Colegio, y el joven mago tendrá que determinar quién es amigo o enemigo para poder detenerlo.